Прозваный римскими тифози 'Il Principino', дебютировал в возрасте 18 лет, в следующем сезоне был отдан в оренду в клуб "Триестина". Аквилани пробился в основной состав Ромы после своего возвращения.
Вместе с Ромой Аквилани четыре раза заканчивал сезон серии A на втором месте, дважды выиграл Кубок Италии, а также один раз Суперкубок Италии.
Альберто Аквилани стал вторым основным приобретением Рафы Бенитеса в летнее трансферное окно 2009 года и позициировался в качестве замены Хаби Алонсо. Он ушел из Ромы для того чтобы принять новый вызов - 7 августа 2009 года Альберото поставил свою подпись под пятилетним контрактом с "Ливерпулем".