Он начал свою карьеру футболиста в клубе АСЕК Мимозас у себя на родине, прежде чем перейти в Беверен в 2002 году.
Тренер "Арсенала" Арсен Венгер приветствовал Эммануэля Эбуэ на Хайбери после того как футболист сбороной Кот-д'Ивуара официально перешел из Беверена в январе 2004 года.
Он забил четыре гола в 65 матчах за бельгийский клуб, и после сыграных
32 матчей за Арсенал в сезоне 05/06, стал полноценным членом команды
Арсена Венгера.
21-летний правый защитник начал тренероватся в первой команде "Арсенала" с 1 января.
"Эммануэль Эбуэ играет преимущественно на позиции правого защитника, но в Беверене в этом сезоне он играл в центре обороны, он может также играть и в полузащите", сказал об Эбуэ Венгер. Эбуэ дебютировал в составе сборной своей страны в сентябре 2003 года в квалификационном турнире Кубка мира в поединке против Судана и уже успел сыграть шесть игр до подписания контракта с канонирами в июле 2004 года.